À propos de

L’idée d’un rencontre entre des ingénieurs travaillant dans des projets de santé numérique à Inria part du constat que les ingénieurs de différents centres ne se connaissent pas et que certains outils/procédures communs dans le processus de développement logiciel au sein des équipes méritent d’être partagés.

Une version initiale de ces échanges est disponible ici:

https://notes.inria.fr/hWTNx9QtQNOmS4pi3b5V1g#

Programme

1er rencontre à Rennes (2022)

(ce programme est susceptible aux changements pendant les prochains jours)

Dates : mercredi 7 et vendredi 8 décembre

Lieu : Inria de l’université de Rennes

Jour 1

  • 10h00-10h30: Accueil
  • 10h30-11h00: Tour de table
  • 11h00-12h00: Activités Santé Numérique (SN) par centre.
    • Lyon (Antoine Fraboulet).
    • Rennes (Eric Poiseau)
    • Bordeaux (Dan Dutartre)
    • Saclay (Benjamin Nguyen-Van-Yen)
    • Paris (Mauricio Diaz)
  • 12h00-13h30: Déjeuner
  • 13h30-15h30: Présentations de projets, partie 1.
    • Primetime IRE (Luc Laffite)
    • RadioNLP (Salim Sadoune)
    • OpenViBE (Thomas Prampart)
    • Shanoir (Michael Kain)
    • HappyFeat, an interactive and efficient BCI framework for clinical applications (Arthur Desbois)
    • Fed-BioMed- Deploying Federated Learning in Real-World Health Applications (Yannick Bouillard, Francesco Cremonesi)
    • Apprentissage Fédéré : logiciel declearn + projets en partenariat avec les CHU de Lille, Amiens, Caen et Rouen" (Paul Andrey)
    • AIstroSight et HyperFlow (Jan-Michael Rye)
  • 15h30-15h45: Pause café.
  • 15h45-17h45: Présentations de projets, partie 2.
    • Clinica (Nicolas Gensollen)
    • ClinicaDL (Camille Brianceau)
    • MedInria (Julien Castelneau)
    • BioImageIT: Integration of data-management with analysis (Leo Maury)
    • MedKit (Olivier Birot)
    • URGE “Analyse des parcours patients aux urgences et optimisation des prises en charge” (Benjamin Nguyen-Van-Yen)
    • Gnomon (Tristan Cabel)

Jour 2

  • 08h00-08h15: Accueil
  • 08h15-10h15: Session de travail 1, Gestion de données
    • Formats: présentations introductoires DICOM (Eric Poiseau), BIDS (Ghislain Vaillant).
    • Accès: PACS, Shanoir
    • Plateformes de données: SNDS, HDH, PDS-Inria (Kim-Tâm Huynh, Mauricio Diaz, Dan Dutartre, rSEDs).
    • Systèmes de contôle de version pour les données.
    • Anonimisation, pseudonimisation
  • 10h15-10h30: Pause café
  • 10h30-12h30: Session de travail 2, Chaine de traitement pour le dev. logiciel
    • Comment les données sont intégrées à la chaîne de traitement (cas spécial pour le traitement féderé) ?
    • Outils pour la chaîne de traitement: Nypipe/Pydra (Ghislain Vaillant).
    • Déploiement de résultats (données, modèles, documentation, tutoriaux). Demostrateurs (e.g., A||go).
    • Tests, CI/CD, outils MLOps.

Venue

Le SED du centre Inria de l’Université de Rennes va accueillir les ingénieurs qui participeront à ce premier rencontre.

Comment venir ?

Adresse :

Campus universitaire de Beaulieu - Avenue du Général Leclerc 35042 Rennes Cedex

Plan d’accès sur Google Map

Depuis la gare SNCF :

Prendre le Métro a à la station Gares (Rennes) en direction de J.F. Kennedy (Rennes) Descendre à la station « République » A la station République, prendre la ligne C4 en direction de ZA Saint-Sulpice ou la ligne C6 vers Cesson Sévigné/Chantepie Descendre à l’arrêt « Tournebride ».

Plus des infos ici